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　　小麦和水稻是全球种植和消费量第二和第三大的谷物，但是这两个主粮的转基因商业化一直以来困难重重，大多数市场对转基因小麦和转基因水稻表现出极大的抵制。因为市场抵制，不足以收回研发成本，孟山都也因此在2004年中止了耐除草剂转基因小麦的开发。此后因为在美国俄勒冈州、华盛顿州和加拿大艾伯塔省发现该转基因小麦导致日本和韩国一度暂停从这些地区进口小麦。

　　此外在1990年代中期，AgroEvo（现在是拜耳公司的一部分）开发了一种转基因水稻，名为Liberty link（LL601），可耐受草铵膦。该品种当时已经获得了美国农业部和美国食品和药物监管局的批准，但是在2001年最终暂停商业化。2006年，因为在出口至欧洲的大米中检出LL601，因此破坏了美国大米出口市场。该事件导致拜耳在2011年赔偿美国水稻种植户7.5亿美元最终和解。

　　另外需要特别提及的是转基因黄金大米的推广。1992年，Ingo Potrykus和Peter Beyer两位科学家在洛克菲勒基金会、瑞士政府和欧盟等机构的资助下，经过7年多的尝试，成功开发出含有胡萝卜素的转基因大米。但是截至目前，根据ISAAA数据库的数据，由国际水稻研究所（International Rice Research Institute）研发的最新一代黄金大米（事件:GR2E）尽管获得了美国、加拿大、新西兰、澳大利亚以及菲律宾监管机构的批准用于食用和饲用或加工，但是暂时还没有国家批准种植该黄金大米。目前，孟加拉国被认为是有可能第一个种植黄金大米的国家，但是因为COVID-19的影响，这一进程可能会往后延期。

　　综合来说，目前各大生物技术公司更多的还是将注意力集中在用于动物饲料、纤维和用于加工的商品作物领域，因为这给农民、消费者以及环境带来了非常大的好处，同时消费者的接受程度较高。而作为广泛食用的粮食作物，特别是水稻和小麦，因为种种原因一直难以更近一步。但是随着像HB4转基因小麦和新一代黄金大米这类产品的出现，相信会给转基因主粮的商业化带来一线曙光。